O Hospital-Escola da Universidade Fernando Pessoa (HE-UFP) dispõe de 3 salas de bloco operatório, sendo uma delas inteligente, com ligação direta para o Auditório e com tecnologia que permite a realização de videoconferências, live streaming e telemedicina. Segundo a Karl Storz, esta sala é atualmente a mais moderna e avançada da Europa.
O bloco operatório do HE-UFP permite e está equipado para realizar todo o tipo de cirurgias nas diversas especialidades médico-cirurgicas, tradicionais, por técnicas endoscópicas, por laser e minimamente invasivas com microscópios de última geração.